选择砧木首先要考虑是否抗土壤传播病害，即西瓜枯萎病;其次要选择与西瓜嫁接之后容易成活，成活后又能正常生长的砧木;三是嫁接成活后植株所结的果实品质不受影响。

目前生产上应用较为广泛的砧木品种有:

一、长瓠瓜

又称瓠子、扁蒲。各地均有栽培。果实长圆柱形和短圆柱形，皮绿白色，茎蔓生长旺盛，根系发达，吸肥能力强。作西瓜嫁接砧木亲合力好，植株生长健壮，抗枯萎病。根部耐湿、耐低温能力比西瓜强。坐果稳定，对果实品质无影响。

二、圆瓠瓜

属大葫芦变种，扁圆形，茎蔓生长茂盛，根系深，耐旱性强。各地都有栽培。作西瓜嫁接砧木亲合性好，植株生长健壮，抗枯萎病，坐果稳定，果实大，对果实品质无影响。

三、长颈葫芦

果实圆柱形，蒂部圆大，近果柄处细长。作西瓜嫁接砧木亲合力好，嫁接成活率也高。植株生长健壮，根系发达，土壤适应性广，吸肥能力强，耐旱、耐涝及耐低温能力较西瓜强。抗枯萎病、坐果稳定，果实大，对果实品质无影响。

四、相生

为瓠瓜杂交种，是西瓜嫁接优良砧木。由日本米可多公司培育，80年代引入我国。作西瓜嫁接砧木亲合力好，成活率高，植株生长健壮，抗枯萎病，根系发达，较耐瘠薄，低温下生长性好，坐果稳定，果实大，对果实品质无影响。

五、勇士

是利用野生西瓜育成的杂交一代西瓜专用砧木。以勇士嫁接西瓜，亲合力好，坐果稳定，果实品质和自根西瓜完全相同。抗枯萎病，植株生长强健，在低温下生长性良好，但嫁接苗定植后初期生育较缓慢，进入开花坐果期生育旺盛。

六、新土佐

是印度南瓜×中国南瓜杂交一代种，作西瓜嫁接砧木，亲合性好，成活率高，幼苗低温下生长性强，抗枯萎病，能促进早熟，提高产量，对果实品质无明显不良影响。但是新土佐不是与所有的西瓜品种都有良好的亲合性，特别是与四倍体和三倍体西瓜表现不亲合，需先进行试验方能使用。

七、超丰F1

是郑州果树研究所用抗病西瓜品种培育的杂交一代砧木，嫁接苗抗枯萎病能力强，嫁接亲合性好，成活率高，对品质无不良影响。

在这些砧木中长瓠瓜、圆瓠瓜、长颈葫芦为农家品种，利用时应选择果形和长势一致的。以免因品种杂乱，砧木苗长势不整齐，影响嫁接时的统一操作和嫁接苗的田间整齐度。而相生、勇士、新土佐、超丰F1等，均为正规育种单位(公司)经试验推广的优秀砧木，它克服了葫芦、南瓜等作砧木的某些不足，经本地试验后可以大面积推厂运用。